Nature：新冠患者转为重症的预警因子被推测

COVID-19病患的表现可以从原发性载运、轻症到需要呼吸机甚至体外腹腔肺氧合（ECMO）维持生命的危诊治病患者，这其当中的关键决定性状况仍然有待解密。同时，新型免疫缺陷是否在扩散反复当中牵涉到突出的基因性状，导致菌株毒力和传染性的扭曲，也亟需大幅度量化。

自禽流感爆发之后，复旦大学自建上海市僖共卫生临床量化区域内（表列简称僖卫区域内）与转化临床国家重大科技产业基础区内（上海）（表列简称区内）、上海血液学量化所、临床遗传物质学国家重点研究团队、瑞金医院临床量化菌株学研究团队，复旦大学上海临床院大分子菌株研究团队、上海交通大学临床院自建同仁医院、北京航空航天大学真菌荷尔蒙生态量化所、上海巴斯德量化所和上海营养与卫生量化所等的单位通力合作，就新型免疫缺陷遗传物质、大分子狂犬病学特质、疟疾临床量化特质进行时了深入量化。

5年末20日，《Nature》杂志发表了这一设计团队的最新量化结果。具体来说，僖卫生区域内卢洪洲教授与区内副所长陈赛娟院士曾三度的联合攻关设计团队，查阅了僖卫区域内在2020年1年末20日-2年末25日期间收治的326举例病患者新种，对菌株遗传物质基因突变、临床量化表现特质和免疫扭曲等零碎数据进行时了全面深度量化。

量化设计团队不断改进技术方法，高质量进行时了112举例新冠菌株遗传物质测序、组装和解析。他们基于菌株遗传物质氨基酸的演化树量化发掘出，新冠菌株主要有两个分支（Clade I 和Clade II）。已确认有西南地区海鲜市场触及史的6举例病患者仅集当中在其当中一个分枝当中（Clade I），而Clade II病患者无该触及史，高亮COVID-19禽流感的牵涉到并不之外西南地区海鲜市场。

新冠菌株遗传物质演化树

接着，通过对禽流感更为严重的不同时间先决条件和不同区域病患者的新冠菌株基因氨基酸（截至2020年3年末初）基因突变特质的相对量化，从上海牵涉到率分离的菌株遗传物质当中识别了169个碱基扭曲，其以此类推出现的性状与已僖布的菌株氨基酸一致，呈现颇为稳定的演化反复，高亮该菌株也许在禽流感现代就已适应在人类消化道当中扩散。同时他们发掘出， 新冠菌株两个分支的扩散性、传染病和临床量化表现等总体无特别是在差异，未发掘出与COVID-19诊治病患者有特别是在系统性的菌株基因突变氨基酸。

COVID-19病患细胞会变化

量化人员从临床量化和免疫学量化发掘出，COVID-19病患者细胞会突出下降，尤为是诊治病患者CD4+和CD8+ T细胞呈特别是在进行时性下降趋势，且炎性特异性IL-6和IL-8突出增高。COVID-19疟疾发展严重程度的决定状况主要与病患者年龄组、基础疟疾及细胞会下降和系统性的特异性飓风众所周知，为疟疾向诊治背离的关键预警因子。

这一量化结果意义不可磨灭，对于大幅度坚信新型免疫缺陷的大分子狂犬病特质、疟疾牵涉到发展特性，为诊治病患现代诊断和治疗，以及为药物和疫苗研发提供者了举足轻重的参考依据。

此外，量化设计团队还向近现代国家组学零碎数据百科全书（The National Omics Data Encyclopedia，NODE） ()、全球猪流感氨基酸零碎数据库(GISAID)和NCBI的国际氨基酸零碎数据库（SRA）知会了112个牵涉到率的新冠菌株遗传物质高质量氨基酸零碎数据。同时，区内也木料了重大疟疾大零碎数据平台新冠菌株遗传物质零碎数据交互式、开源在线量化网站（）。国内外科研的单位和科学家仅可完全共享系统性量化零碎数据。

零碎出处：

Xiaonan Zhang, Yun Tan, Yun Ling, et.al. Viral and host factors related to the clinical outcome of COVID-19. Nature 20 May 2020